コンテンツを HTML に埋め込んでる訳ではないので、外部ファイルの内容を適宜 JavaScript で読み込んでくる感じなんでしょうね。
JavaScript を無効にしてもリンクできるので、各ページの HTML 自体は存在していて、JavaScript が有効になっているときはその中から特定の範囲を拾ってくる、という感じではなかろうかと思われます。

ページの切り替えが無い分だけ処理も早くなってるような気もするんですが、ヘッダーやグローバルナビが出っぱなしっていうのも少し物足りないような。